ZJohnsonの海马体

海马体它总记得


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无损系统迁移

发表于 2019-11-29 | 分类于 PC tools | 评论数:

前言

老笔记本早就想升级了,也买好了多余的固态硬盘。昨天清灰总算逮到机会了。一起就安装上了,SATA3接口的影驰240G,180左右,三年换新,还可以。起码跟机械硬盘有质的区别。

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释怀

发表于 2019-10-14 | 分类于 Poetry | 评论数:
唏嘘成愁

唯黄昏而思烛明 唯覆雪始念日暖
唯放手方知情真 今困苦而怀峥嵘
今飘零而涌乡愁 今孑然而徒唏嘘


        

Python曲线平滑处理

发表于 2019-09-29 | 分类于 Python | 评论数:

背景

在用Python画函数图形时发现曲线不平滑,百度发现解决方案核心思想是插值法,即将定义域的取值点增加到原来的100倍甚至以上,即可达到曲线平滑的目的。所以仅仅需要增加取值点的个数。

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缺少库libssl.so和libcrypto.so

发表于 2019-09-15 | 分类于 Linux | 评论数:

起因

服务器上安装Aria2需要这两个库,网上检索到仅需要安装openssl即可,但是尝试后并没成功。

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Pychrm pro 2019.1下载安装及永久破解

发表于 2019-09-07 | 分类于 PC Tools | 评论数:

前言

近期需要安装Pycharm,有强迫症要安装最新版本,又想要
永久破解。学习了好久,终于成功了。还是激活码给力,其他的地方也有新的发现。

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RPKM、FPKM和TPM

发表于 2019-09-06 | 分类于 Bioinfomatics | 评论数:

前言

在重复Nature Prtocol的RNAseq流程中看到了FPKM,就想起来了这三个概念。现在把它们分辨清楚。

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搭建Aria2满速下载神器

发表于 2019-08-17 | 分类于 PC Tools | 评论数:

前言

恰逢新装百兆宽带,无奈下载的资源仍然被限速,尤其是遇到某盘的资源。更是焦头烂额。早听闻Aria2可以完全发挥宽带潜能,但无奈搭建还是有几分复杂(其实我懒)。前几日耐着性子把它搭建好。

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RNA-seq数据初步分析流程1

发表于 2019-05-16 | 分类于 RNA-seq | 评论数:

前言

花了四个月左右时间做的毕设,到现在才有时间(其实我懒)记录过程。

HISAT2报错解决

发表于 2019-04-23 | 分类于 RNA-seq | 评论数:

报错信息:

  1. Error while flushing and closing output
    terminate called recursively
    terminate called after throwing an instance of ‘int’
    (ERR): hisat2-align died with signal 6 (ABRT) (core dumped)
  2. Error:Encountered internal HISAT2 exception (#1)

原因及解决方案:

  1. 硬盘不足,腾出空间即可,或者先把hisat2的已经运行完整的sam文件转为bam文件,可节约空间。
  2. 遇到此类报错,原因是输入了不能识别的参数,包括空格(多、少)、符号(短横线、双短横线、逗号等)。请仔细检查命令行的输入。

利用IGV判断测序是否为链特异性测序

发表于 2019-04-08 | 分类于 RNA-seq | 评论数:

起因

在学习RNA-seq的过程中,用以前的(2015年左右)生物信息分析流程的tophat和htseq等软件,需要在参数中指出建库类型,否则对结果产生较大的影响。

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