During 12.22-12.24

发表于 2019-01-10 | 分类于 Poetry | 评论数：

路途所感

瞥高山流水噫仙雾缭绕
于魔音灌耳感思绪飞扬
间始觉故里房屋几座农家人
余忆吾幼年终日嬉戏无劳神
他乡苦寒窗数载师承先德苦栽培
不知学子才尚浅搁至此久得空闲
绒雪纷飞不觉寒道过中途迫遣返
早知落雪差池生何须改日把家还

Enrichment analysis of GO & KEGG

发表于 2018-12-20 | 分类于 RNA-seq | 评论数：

前言

GO是Gene ontology的缩写，是一系列用来描述基因、基因产物特性的语义（terms）。KEGG（ Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes），是一个系统分析基因产物在细胞中代谢途径的数据库，是一种最常用的代谢通路分析。

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Differential expression analysis -- DESeq2

发表于 2018-12-19 | 分类于 RNA-seq | 评论数：

前言

DESeq2 是一款基于负二项分布的R包，对于 count data 进行处理，用于 RNA-seq 基因差异分析。

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Gene expression levels analysis -- HTSeq-count

发表于 2018-12-14 | 分类于 RNA-seq | 评论数：

前言

HTSeq 是一款针对于有参考基因组的，分析高通量测序数据的Python库。
官网： HTSeq

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Mapping -- HISAT2

发表于 2018-12-11 | 分类于 RNA-seq | 评论数：

前言

针对一般人类群体（以及有参考基因组的群体），HISAT2是一种快速灵敏的比对程序，用于绘制第二代测序序列（全基因组，转录组和外显子组测序数据）。是有参转录组常用的比对软件（无参常用bowtie2），HISAT2是TopHat2/Bowtie2的继任者，使用改进的BWT算法，实现了更快的速度和更少的资源占用。

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Quality control -- Fastp

发表于 2018-11-29 | 分类于 RNA-seq | 评论数：

前言

Fastp是一款旨在提供FastQ文件快速的一体化预处理工具。由C语言开发且支持多线程的高性能表现。

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Hello World

发表于 2018-11-13 | 分类于 Hexo | 评论数：

初始文章

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ZJohnson

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