起因

服务器上安装Aria2需要这两个库，网上检索到仅需要安装openssl即可，但是尝试后并没成功。

前言

近期需要安装Pycharm，有强迫症要安装最新版本，又想要
永久破解。学习了好久，终于成功了。还是激活码给力，其他的地方也有新的发现。

前言

在重复Nature Prtocol的RNAseq流程中看到了FPKM，就想起来了这三个概念。现在把它们分辨清楚。

前言

恰逢新装百兆宽带，无奈下载的资源仍然被限速，尤其是遇到某盘的资源。更是焦头烂额。早听闻Aria2可以完全发挥宽带潜能，但无奈搭建还是有几分复杂（其实我懒）。前几日耐着性子把它搭建好。

前言

花了四个月左右时间做的毕设，到现在才有时间（其实我懒）记录过程。

报错信息：

1. Error while flushing and closing output
   terminate called recursively
   terminate called after throwing an instance of ‘int’
   (ERR): hisat2-align died with signal 6 (ABRT) (core dumped)
2. Error:Encountered internal HISAT2 exception (#1)

原因及解决方案：

1. 硬盘不足，腾出空间即可，或者先把hisat2的已经运行完整的sam文件转为bam文件，可节约空间。
2. 遇到此类报错，原因是输入了不能识别的参数，包括空格（多、少）、符号（短横线、双短横线、逗号等）。请仔细检查命令行的输入。

起因

在学习RNA-seq的过程中，用以前的（2015年左右）生物信息分析流程的tophat和htseq等软件，需要在参数中指出建库类型，否则对结果产生较大的影响。

起因

因学习需要，使用 samtools 0.19和HTSeq0.6.1p1，遇上几个不常见的报错信息。特做记录。

起因

学校服务器linux版本过低，想安装生物信息学软件未果，但在折腾过程中学到很过新的指令，记录在此以免忘记。