无损系统迁移 发表于 2019-11-29 | 分类于 PC tools | 评论数: 前言老笔记本早就想升级了,也买好了多余的固态硬盘。昨天清灰总算逮到机会了。一起就安装上了,SATA3接口的影驰240G,180左右,三年换新,还可以。起码跟机械硬盘有质的区别。 阅读全文 »
Python曲线平滑处理 发表于 2019-09-29 | 分类于 Python | 评论数: 背景在用Python画函数图形时发现曲线不平滑,百度发现解决方案核心思想是插值法,即将定义域的取值点增加到原来的100倍甚至以上,即可达到曲线平滑的目的。所以仅仅需要增加取值点的个数。 阅读全文 »
缺少库libssl.so和libcrypto.so 发表于 2019-09-15 | 分类于 Linux | 评论数: 起因服务器上安装Aria2需要这两个库,网上检索到仅需要安装openssl即可,但是尝试后并没成功。 阅读全文 »
Pychrm pro 2019.1下载安装及永久破解 发表于 2019-09-07 | 分类于 PC Tools | 评论数: 前言近期需要安装Pycharm,有强迫症要安装最新版本,又想要永久破解。学习了好久,终于成功了。还是激活码给力,其他的地方也有新的发现。 阅读全文 »
RPKM、FPKM和TPM 发表于 2019-09-06 | 分类于 Bioinfomatics | 评论数: 前言在重复Nature Prtocol的RNAseq流程中看到了FPKM,就想起来了这三个概念。现在把它们分辨清楚。 阅读全文 »
搭建Aria2满速下载神器 发表于 2019-08-17 | 分类于 PC Tools | 评论数: 前言恰逢新装百兆宽带,无奈下载的资源仍然被限速,尤其是遇到某盘的资源。更是焦头烂额。早听闻Aria2可以完全发挥宽带潜能,但无奈搭建还是有几分复杂(其实我懒)。前几日耐着性子把它搭建好。 阅读全文 »
HISAT2报错解决 发表于 2019-04-23 | 分类于 RNA-seq | 评论数: 报错信息: Error while flushing and closing outputterminate called recursivelyterminate called after throwing an instance of ‘int’(ERR): hisat2-align died with signal 6 (ABRT) (core dumped) Error:Encountered internal HISAT2 exception (#1) 原因及解决方案: 硬盘不足,腾出空间即可,或者先把hisat2的已经运行完整的sam文件转为bam文件,可节约空间。 遇到此类报错,原因是输入了不能识别的参数,包括空格(多、少)、符号(短横线、双短横线、逗号等)。请仔细检查命令行的输入。
利用IGV判断测序是否为链特异性测序 发表于 2019-04-08 | 分类于 RNA-seq | 评论数: 起因在学习RNA-seq的过程中,用以前的(2015年左右)生物信息分析流程的tophat和htseq等软件,需要在参数中指出建库类型,否则对结果产生较大的影响。 阅读全文 »